En 1930,  se decidió transferir los objetos de Volubilis a Rabat para crear un gran museo arqueológico en el centro de la capital. Las salas de exposiciones se construyeron alrededor del edificio administrativo. El museo tomó su forma arquitectónica definitiva en 1952, con la finalización de la gran sala ovalada (sala de bronce).

En 2014, el Museo Nacional de Arqueología de Rabat, como 13 otros museos marroquíes, está a cargo de la Fundación Nacional de Museos. Luego se decidió renovar el edificio, reorganizar ligeramente la exposición permanente y reabrir el museo en abril de 2017 con el nombre de “Museo de Historia y Civilizaciones”.